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1、就性质而言，机电工程施工总承包资质属于总承包资质序列；建筑机电安装工程专业承包资质属于专业承包资格的顺序。一个是专业承包，另一个是总承包，性质明显不同。

2、从等级方面来说，机电工程施工总承包资质与建筑机电安装工程专业承包资质等级均分为一级、二级、三级三个等级。但是二者办理的条件和可以承包的范围是大不相同的，机电总承包资质是包含建筑机电安装工程专业承包资质的，但是也大于专业承包资质，所以二者是包含与被包含的关系。

除此之外，两者申请资质标准也不同，机电总承包资质申请要求相对比较高。以三级资质为例，总承包资质要求企业净资产800万以上，而专包资质净资产只需达到 400万。办理机电工程施工总承包资质所需的各类注册人员几乎是机电安装工程专包资质的两倍。

3、从承担业务范围看，机电总承包资质三级可承担单项合同额1500万元以下的各类机电工程的 施工，而建筑机电安装工程专业承包资质三级只能承担单项合同额1000万元以下的各类建筑工程 项目的设备、线路、管道的安装，非标准钢结构件的制作、安装。

值得注意的是，还未落地的资质改革方案中，机电设备安装资质与城市道路照明资质合并为建筑机电类专业承包，且不分等级。新的资质标准落地后，机电安装资质的承包范围将区别于机电总包资质，机电安装企业的业务类型会更为丰富，也会面临更多竞争对手的冲击。在实际办理的过程并非文字上那么简单。